A urina dos pacientes era normal e a infecção não foi a principal causa da fibrose da parede da bexiga. Alguns estudiosos acreditam que a obstrução linfática causada por cirurgia pélvica ou infecção é a causa, mas muitos pacientes não apresentam esse histórico. Outros estudiosos propuseram que isso se deve a tromboflebite acompanhada de infecção aguda da bexiga ou órgãos pélvicos, ou devido a espasmo-de longo prazo de pequenas artérias causado por estresse mental, e também pode estar relacionado a fatores endócrinos. Extensas evidências sugerem que a cistite intersticial é uma doença autoimune do colágeno. O papel dos mastócitos e dos glicosídeos de aminoácidos da superfície da bexiga na cistite intersticial tem atraído atenção, e alguns pesquisadores estão atualmente conduzindo estudos nesta área.
Os pacientes geralmente apresentam frequência urinária progressiva, urgência e noctúria a longo prazo. A dor na região suprapúbica é significativa quando a bexiga está cheia e, às vezes, também pode ocorrer dor uretral e perineal, que é aliviada após a micção. A hematúria pode ocorrer ocasionalmente e é mais pronunciada quando a bexiga está cheia e distendida. Alguns pacientes podem ter histórico de doenças alérgicas.
