A cistoscopia sob anestesia pode diagnosticar cistite intersticial. Inicialmente, a aparência e a capacidade da bexiga são normais, mas após o enchimento, esvaziamento e reenchimento da bexiga, são frequentemente observadas hemorragias submucosas dispersas. A biópsia revela alterações patológicas na camada subepidérmica, incluindo edema, congestão, telangiectasia e hemorragia intersticial perivascular. Também pode ajudar a descartar alguns carcinomas in situ e lesões tuberculosas. Na vulvite localizada, pequenas lesões eritematosas estão presentes no vestíbulo lateral do hímen, enquanto o restante das lesões é normal.
A cistite aguda também apresenta sintomas de irritação da bexiga, como frequência urinária, urgência e disúria. Contudo, a hematúria terminal é comum e a urina contém um grande número de glóbulos brancos; a cultura da urina revelará bactérias. A cistite glandular também apresenta sintomas de irritação da bexiga, como frequência urinária, urgência e disúria. No entanto, o exame de ultrassom pode revelar espessamento da parede da bexiga ou lesões que ocupam espaço dentro da bexiga. A cistoscopia revela estruturas papilares em vez de úlceras superficiais, e a biópsia pode confirmar o diagnóstico. A tuberculose da bexiga também pode se apresentar como úlceras verdadeiras, afetando frequentemente a área ao redor do orifício ureteral na lateral do rim tuberculoso. Pode ocorrer piúria e o bacilo da tuberculose pode ser encontrado na urina. A imagem do trato urinário pode mostrar alterações típicas da tuberculose renal. As úlceras da bexiga causadas por doenças parasitárias assemelham-se à cistite intersticial e geralmente são mais comuns em homens. O diagnóstico pode ser feito com base na presença de ovos do parasita na urina ou em características patológicas típicas da bexiga. A cistite inespecífica raramente se apresenta com úlceras na bexiga; células de pus e bactérias infecciosas são comumente encontradas na urina e o tratamento com antibióticos é eficaz.
